في مصر، يركز برنامج الصحة العامة للمفوضية على الرعاية الصحية الأولية ويدعم الرعاية الصحية من المرتبتين الثانية والثالثة والرعاية الصحية المنقذة للحياة. في عام 2016، وقعت وزارة الصحة والسكان والمفوضية السامية للأمم المتحدة لشؤون اللاجئين مذكرتي تفاهم تمنحان اللاجئين وطالبي اللجوء من جميع الجنسيات إمكانية وصول متساوية للرعاية الصحية الأولية والثانوية والطوارئ كمواطنين مصريين.

نركّز دعمنا على المرافق العامة الأولية في المناطق التي تستضيف أعدادا كبيرة من اللاجئين. من خلال شركائنا، نقدم أيضا الرعاية الصحية للمرضى الذين يعانون من الأمراض المزمنة ونقدم الدعم للصحة النفسية الاجتماعية والعقلية والرعاية الثانوية ونظام الإحالة لظروف إنقاذ حياة جميع اللاجئين.

في المناطق ذات الكثافة العالية من اللاجئين وطالبي اللجوء، تدعم المفوضية الجهود الوطنية لتحسين جودة الخدمات لتلبية احتياجات اللاجئين وكذلك احتياجات السكان المُضيفين. يستتبع ذلك تعزيز النظم الصحية الوطنية القائمة من خلال بناء القدرات وتوفير المعدات.